XCMS online tool used for analyzing non-targeted metabolomics data

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新建任务

• 查看可之间上传的文件格式

  

可上传的数据格式

若不满足以下数据格式，可使用ProteoWizard进行转换。

Ailgent的数据格式.d需要进行转换，通常可以将其转换为.mzxml。否则是无法整个上传，会将文件夹中的所有文件分开上传。转换后数据如下：

上传需要比较的文件

先上传对照组，生物学重复一起上传

上传了数据集1共4个文件,点击next

上传处理组

选择参数

修改项目名，点击submit

查看进展

提交完会直接跳转到改进展页面，也可以在View Results中看处理结果。

过一段时间刷新后，可看到已经处理45%

View分析之后的结果

点击view

可以看到这些结果

点击metabolic cloud plot

图中绿色的代表含量显著升高；红色代表显著下降。

可以将云图下载为png，jpeg，或者svg矢量图。

table view

点击箭头处的按钮，进入列表模式，看到左右显著变化的物质。

列表信息显示很多参数，fold，up or down, RT and so on.可以点击下载表格，进行进一步分析。

点击表格上的行可以再表格右边显示feature详细信息，包括EIC和MS spectrum，以及最右下角可能物质的展示。